A História da  E.E Prof. Maria Isabel dos Santos Mello confunde-se com a própria história do Distrito de Jundiapeba, uma vez que a região era formada por propriedades rurais, dentre elas a da Irmandade do Carmo, onde hoje está localizada a capela de Santo Ângelo. 

Era nas propriedades rurais do início do século XX que a população recebia atendimento educacional. Foi na "Escola Mista Rural  do Rio Abaixo" que a Professora Maria Isabel dos Santos Mello, veio lecionar, no ano de 1919, porém essa unidade só atendia até a 3ª série do antigo curso primário

Já em 1946 foram construídas mais outras duas escolas isoladas.

Por solicitação da comunidade escolar, local, a Secretaria de Estado da Educação criou, em 24 de janeiro de 1953, o "Grupo Escolar de Jundiapeba", com a unificação dessas unidades escolares, por Decreto publicado em 27 de janeiro de 1953, tendo sido instalada em três casas cedidas pela empresa Brasil Viscose. Sua primeira diretora foi a Professora Maria Aparecida de Sousa Mello, afilhada da Professora Maria Isabel dos Santos Mello.

A Senhora  Professora Maria Aparecida de Sousa Mello, no ano de 1954, solicitou aos políticos da cidade para que essa escola recebesse o nome de sua madrinha, uma vez que ela havia lecionado no "Grupo Escolar do Rio Abaixo".

O Decreto nº 23.376, de 28 de maio daquele ano, que designava o nome do Grupo Escolar Professora Maria Isabel dos Santos Mello" ao antigo Grupo Escolar de Jundiapeba.

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